Jogar no modo multijogador em Marvel Battlegrounds é fácil: apenas use um de seus personagens físicos da Marvel em sua base de Disney Infinity e jogue. A base irá registrar cada personagem na biblioteca da tela de seleção do jogo, onde eles ficarão durante toda a sessão da partida versus. Após carregar seu personagem no jogo, o personagem físico não precisa mais ficar na base durante aquela sessão de jogo. Porém, você precisará recarregar seus personagens após fechar o jogo.

Multijogador nos modos História ou Desafio funciona como qualquer outra função multijogadora de Playset: coloque cada jogador designado em seu próprio local na base Infinity para jogar.