Att spela i flerspelarläget i Marvel Battlegrounds är enkelt. Det är bara att sätta någon av dina Marvelfigurer på Disney Infinity-basen och spela. Basen loggar in varje figurerna till spelets figurväljarskärm, där de förblir under hela spelsessionen i versusläget. När du har laddat in figuren i spelet kan du spela med den utan att den står kvar på basen under den spelsessionen. Du måste dock ladda in dina figurer igen när du avslutar spelet.

Flerspelarläget i storyn eller utmaningsläget fungerar på samma sätt som flerspelarläget i andra playset – ställ varje spelare på rätt plats på Infinitybasen för att spela.